鄭成功和鄭鴻逵無奈退了出來，兩人走到無人的地方，鄭成功道︰“叔父，我看父親降清的心意已決，咱們得早做準備才行。”鄭鴻逵道︰“依你說，咱們該怎麼做？”鄭成功道︰“火速趕去行在，把皇上接出城，然後集齊你的本部兵馬，護送皇上先去安全的地方再說。”
鄭鴻逵道︰“難道你爹他真敢冒天下之大不韙，做出弒君的事來？”鄭成功道︰“事到如今，咱們凡事都要做最壞的打算。”
其實鄭成功所慮絕非杞人憂天。他和鄭鴻逵都不知道的是，鄭芝龍回去之後，內心激烈斗爭半夜，竟走回書房，將被撕碎的書信又一片片撿了回去，又用了半夜功夫拼了起來。博洛在信中不僅提到致歉和見面的事，還要求鄭芝龍帶兵沖入行在，將隆武帝生殺了，給大清做投名狀。
好在鄭芝龍縱然再跋扈自私，對于這個自己親自迎立的皇帝，終究是不敢也不願做出弒君這樣大逆不道的事來。他日鄭芝龍降清，多爾袞和博洛得知他執意不肯殺隆武帝的事，對他多有不滿。這也是他投降後非但未能如願以償封王，反而終其一生被軟禁，最終郁郁而死的原因之一，自然這都是後來的事了。
鄭鴻逵道︰“這福州城里的兵馬大多是你爹的部下，我的兵馬都駐扎在泉州、廈門等地，我眼下能調動的也就只有府中的幾百親軍了。”鄭成功道︰“足夠了。咱們接了皇上，先去廈門安身，一面召集兵馬與清軍交戰，一面請皇上發詔書號令天下兵馬勤王。”
鄭鴻逵嘆道︰“唉，怎麼就會走到這一步啊。”于是叔佷兩人商議停當，鄭成功便帶了幾名親信護衛來到行在。守門衛士問他為何深夜來此，鄭成功就說自己奉了鄭芝龍之命，有要事求見皇上。
他是平南侯世子，誰敢阻攔？鄭成功見到隆武帝，如實說了父親私放清軍入關，意欲降清的事。隆武帝听了，既震驚又憤怒，“這個國賊！朕必殺之！”鄭成功勸他暫息雷霆之怒，現在情勢危急，再留在福州，只怕隨時會遭遇不測，請他馬上改裝易服，扮做自己的隨從，先逃出城去，再圖良策。隆武帝沉思片刻答應了。
鄭成功留下一個身材和隆武帝相似的親信穿上他的龍袍蒙蔽守衛，自己則帶著隆武帝出了行在，直奔東門。那邊鄭鴻逵已經領著幾百親軍等候接應，謊稱奉鄭芝龍之命，連夜出城調集兵馬，加強福州防務。守門將領原是鄭鴻逵部下，又有世子和鄭鴻逵兩人親自前來，哪有絲毫懷疑，開門放他們出去了。
天亮之後，行在和城門的守軍紛紛發現了異常，連忙去向鄭芝龍稟報，說了隆武帝走失和鄭成功叔佷出城的事。鄭芝龍一听先是一驚，繼而嘆息一聲，心下反而坦然了，“走吧，走了也好。”
手下兵將沒理會他意思，還以為是在怪他們看管不力，道︰“我等這就集合兵馬，出城去追。”鄭芝龍擺擺手，道︰“不必了。”
此刻的他經過一夜思量，到底還是選擇了降清的路，準備即刻出城，去見博洛，別的他已無心去管了。至于隆武帝，反倒希望他走的越遠越好，也省的自己為難。
就與此同時，鄭成功叔佷護送著隆武帝出了城，便馬不停蹄來到福州城東南的長樂縣，才駐足歇馬，準備稍事休息便乘船出海，南下泉州廈門。
可隆武帝忽然說什麼也不肯走了，說道︰“朕不信鄭芝龍真會不惜落下千秋罵名去降清，朕要回去，對他曉以大義，勸他回頭。”鄭氏叔佷一听，急忙勸道︰“陛下已脫虎口，萬不可再以萬金之軀，回去犯險。”
隆武帝卻很決絕，“哪怕只有一線希望，朕都要試一試。朕身為一國之君，在此國難當頭之際，若是只顧著自己逃跑，扔下自己的臣民不管，那與宋高宗之流有什麼分別！”鄭鴻逵道︰“非是臣等給皇上潑冷水，臣叔佷兩人也曾苦心相勸，無奈鄭芝龍反心已明，皇上此時回去，就怕勸說不成，反遭了毒手。”隆武帝道︰“就算他鄭芝龍執迷不悟，朕就不相信他手下人會都跟著他走，朕要以大明皇帝的名義，親自下旨，號令三軍討賊！”
鄭鴻逵心中暗嘆隆武帝的想法天真，道︰“那些人跟隨鄭芝龍已久，唯他之命是從，只怕……”他原想說“只怕皇上的聖旨對他們來說不起作用”，但又覺這會深深傷了隆武帝作為一個帝王的自尊，沒有說出來。
隆武帝固然也明白他的意思，非但不怒，卻微笑道︰“你們叔佷二人，不但跟隨他時間長，還是他的至親，不也心懷忠義，不肯與他同流合污嗎？數萬將士，朕不信就沒有一個忠義之士！朕意已決，卿等不必再勸。”
鄭成功道︰“既如此，臣願只身回去，替皇上傳旨。”鄭鴻逵驚訝道︰“這怎麼行？”隆武帝也道︰“你是大明未來的柱石，若有個閃失，叫朕何以自處。”鄭成功道︰“大明可以沒有任何人，但不能沒有皇上，為了天下，皇上也不能犯險，請皇上快快下旨吧。”
隆武帝走上前抓著他的手，動情道︰“朕一直覺得，老天待我何薄，讓朕陷入如此絕境。可老天又待我何其之厚，在如此絕境中，還有你陪著朕。如此，就拜托你了。”
于是隆武帝速速寫好了聖旨，交鄭成功帶著，快馬趕回了福州。來到福州城下，守門將領一看他來，慌忙下城迎接，“世子，您可回來了！”鄭成功見他滿臉驚惶之色，問道︰“怎麼了？”守將道︰“侯爺，侯爺他……”鄭成功喝問道︰“侯爺他怎麼了？”守將道︰“他走了。”
鄭成功心頭一驚，不用他再說，已經知道鄭芝龍去了哪兒，撥轉馬頭，就往西疾馳而去。
一切如他所想，鄭芝龍一早召集親信部下，說了自己要降清的決定。眾人雖感震驚，但他們多年跟隨鄭芝龍，早已形成了牢固的人身依附，認定了只要跟著他，就能有富貴前程，至于家國大義，他們不懂也不在乎，因此除了甘輝等少數幾人極力勸阻，大多人選擇了附和或者沉默。
鄭芝龍既鐵了心，自然不是誰能勸得了的，正要出門，施瑯提出，即便要去，也要帶大隊兵馬一起去，以防有詐。鄭芝龍不以為然，他是誠意歸降，帶那麼多兵馬去作甚？反而引起清人的疑忌，壞了大事。于是最終只帶了五百隨從，出城去了。
鄭成功策馬奔出三十余里，終于追上了鄭芝龍的車駕，護衛親兵一見來人是世子，連忙報給鄭芝龍。
鄭芝龍一听他是只身來追，才放心地下車迎了上來，問道︰“你怎麼來了？”鄭成功只是面無表情地看著他。
鄭芝龍又問︰“是皇上派你來的吧。”見鄭成功還是不答，鄭芝龍也有些急了，“他派你來，究竟有什麼事，快些說吧，我還要急著趕路。”
鄭成功摸了摸袖中地聖旨，卻沒有拿出來。“不，不是皇上，是我自己要來的。爹，你到底還是要走嗎？”鄭芝龍道︰“哼，你呢，你還不是先我一步，不辭而別？既已走了，還回來做什麼？”鄭成功道︰“只為孩兒還有最後幾句話要跟你說。”
鄭芝龍不耐煩地轉過身去，道︰“我心意已決，要麼今天你跟我一起走，要麼就快些回去，不必再費唇舌了！”鄭成功高聲道︰“我不是來勸你的！我更不會跟你走。”鄭芝龍疑惑道︰“那你是？”
“唰！”鄭成功從腰間猛地拔出撿來，鄭芝龍的隨從見了，以為他情急之下要殺鄭芝龍，連忙也刀劍出鞘，上前護衛。
鄭芝龍卻最了解兒子，知道他縱然再怎麼對自己感到失望，也斷不會做出弒父的事來，揮手讓他們退下。
果然，鄭成功的劍並沒有指向鄭芝龍，而是移向了自己的左掌，隨著劍鋒在他左掌上緩緩劃過，鮮血沿著劍鋒流了下來。
鄭芝龍驚道︰“你干什麼？”鄭成功道︰“爹，是您帶我來到這個世上，也是您撫養我長大，這些年您為了孩兒付出的心血，孩兒全都銘刻在心。原本父有命，子不可不從，此乃人倫之常。可孩兒想，父子之倫，畢竟大不過君臣之義，一家榮辱，終究比不了天下興亡！請恕孩兒寧死不肯屈身事賊，今日一別，你我便成仇敵。孩兒的生命是您給的，本當一並還給您，奈何孩兒還要留此有用之軀，去殺敵破賊，為母親報仇，為千萬無辜慘死的百姓雪恨。這一仸熱血，是您所賜，孩兒就用它，還了您的養育之恩！他日相見，你非我父，我非你子，咱們各為其主，死生有命，誰也不必留情！”
鄭成功一番話說的慷慨激昂，就連鄭芝龍身邊的一眾心腹親隨听了，也無不動容，有的甚至忍不住暗暗落下淚來。
鄭芝龍痛苦地閉上眼，不忍再看兒子，仰天一嘆，終于還是走回車上，下令啟程了。