户部进行过详细的计算，认为如果能够将这些措施实施到位，可以为朝廷增加收入三百到四百五十万石本色，这对于大明朝廷来说确实是一个巨款，尤其是本色田赋的增加，对于朝廷充实仓储来说，确实是一个极为重要的事情。
同时户部还要求将对于受灾省份的优免暂停作为一种制度固定下来，毕竟现在朝廷灾荒严重，百姓困顿，朝廷需要大量的粮秣来赈济灾民，安抚地方，这点是很重要的，这些受灾省份，地方官府本来财政困顿，暂停优免，可以使得地方官府能够有足够的钱粮维持正常的运转。
对于户部所提出的这个方案，朱常洛认为还是比较合适的，既维持了朝廷现有的优免制度，同时也要增加朝廷的财政收入，打击优免冒滥，稳定整个官僚团体，再加上之前朱常洛大幅度的提高了官俸，现在对于限制优免，官员们实际上的抵触心理没有那么强。
毕竟即便是按照户部所制定的整顿优免则例，他们仍然可以享受很大的优免。
孙如游就说道：“陛下，臣为浙江人，对于东南之事还是略有耳闻的，浙直之优免大弊，在于诡寄，而诡寄之来源，多为客户滥免，今将通县优免数目，本邑乡绅举贡等项若干，客户若干，别户若干，据现造册籍，先送阖邑缙绅公议。客田之滥免不可问，则不得不取盈于额田，富户之花诡不可问，则不得不归并于穷户。”
孙如游其实就将浙直两省优免冒滥的一个逻辑说清楚了，客户的滥免无法清查，赋役就必然加征于额田；富户的花诡无法制止，负担就必然转嫁给穷户。
东南由于士绅豪强甚多，他们的土地往往跨州连郡，假借官身，大加优免，而地方州县官员，畏惧权势，不敢清查，要么就是拖欠朝廷的正项田赋，要么就是将这些赋税转嫁给普通百姓。
导致这些百姓的生活更加困苦，这次朝廷整顿优免，彻底禁止这些客户，即便是朝廷官员，也只能够在自己的籍贯内按照朝廷规定享受优免，至于其他的生员、举人等的优免，则是一并取消，官员在其他地方的土地，也一样不能享受优免。
不过这次取消生员、举人的优免，还是引发了叶向高等人的担忧。
户部的态度是很坚决的：“废天下之生员、举人之优免，而百姓之困苏。今朝廷赋役无多，士夫优免，向止本户，迩年以来，影射隐蔽，奸冒日滋于下。而司审编者，或狃容徇之私，或乏振刷之用，其间弊端，未易穷诘，偏累小民，逼死逃亡者亦不少矣。”
朝廷对于生员、举人，本来已经有政治上的优待了，而且现在的这些生员、举人们，入仕的机会并不少，朱常洛认为在这种情况下，仍旧对于他们再实施优免，不合时宜的。
叶向高则是说道：“陛下，今日之生员、举人，诚地方官府之害也！其朋比胶固，牢不可解。书牍交于道路，请托遍于官曹，其小者足以蠹政害民，而其大者，至于立党倾轧，取人主太阿之柄而颠倒之，皆此之繇也。把持县官，辄于白昼之中搜截差役，抗违宪法，敢于会城之内阻掣批文，种种穷凶极恶，真有罄竹难书，流波不尽者。然而梓里不敢发，官府不敢问，则其积威所劫，触之而必碎，犯之而必焦也。”
现在大明的这些生员、举人，在地方横行不法，已经不是什么稀奇的事情了，他们在地方有极为深厚的关系，而且往往互相之间呼朋引伴，结伙对抗官府，而由于朝廷对于这些生员、举人的种种特殊待遇，使得地方州县官员往往无法将他们绳之以法。
李腾芳就说道：“陛下既然要整顿优免，彼辈绝不肯坐视的，不若整顿士风，严敕地方府州与学政，对于冒滥优免，且拒不自首者，革除功名，以儆效尤。彼辈居乡也，一登科第，志切馈遗；欲广侵渔，多收投靠。妻宗姻娅，四出行凶；子弟豪奴，专攻罗致。女子稔色，则多方委禽；田园遂心，则百计垂饵。钉田封屋，管业高标者某府某衙；诉屈声冤，公事至偃者何科何院。曲直挠乱，白黑苍黄。庇远亲为宦户，挤重役于贫民。事事贴赔，产已卖而役仍在；年年拖累，人已毙而名未除。”
对于这些生员、举子，朝廷要加大整治的力度，免得他们在地方搞事情，朱常洛于是当场批准了户部的条陈，命令户部立即行文天下，整顿地方的优免冒滥，取消生员和举人、寺院等在经济上的特权，保障朝廷的财政收入。
朝廷的命令下达之后，不少的地方官员是支持此事的，他们早就饱受这些士绅的掣肘，一方面是朝廷越来越严厉的考成，赋税要收缴，同时还不能在地方激起民变，而另一方面也要和这些士绅、地方豪强们勾心斗角，这使得地方官员们也是极为痛苦的。
同时翰林学士掌院事、礼部右侍郎刘一燝也上疏称：“近来有等奸徒，利他处人才寡少，往往诈冒籍贯，投充入学，及有诡写两名，随处告考，或假捏士大夫子弟，希图进取，或原系娼优隶卒之家，及曾经犯罪问革，变易姓名，援例纳粟等项幸出身，殊坏士习。”
现在有通过冒籍、捐纳等方式取得功名的，还有各种不符合朝廷规定取得功名的，要通令地方官府查察之后移送学政，将其功名予以革除，保障大明朝廷功名的严肃性。
朱常洛自然是予以批准同意了，除此之外，户部奏请在受灾省份暂停优免一到三年，以保证朝廷的财政，缓解地方百姓的困难，这点也得到了朝廷上下的支持。
吏部尚书申用懋则是上疏请求仿照前宋之制，在地方将享受优免的群体列为形势户，将他们的田产、赋税等单独管理，免得他们兼并土地。