与此同时，主世界，合众地区。
小智、艾莉丝和天桐的旅途，终于抵达了以矿业和贸易闻名的帆巴市。
“太好了！终于到了！我要立刻去挑战道馆！”小智干劲十足地冲向那座风格粗犷的帆巴道馆。
然而，他们却在道馆门口吃了个闭门羹。
一位矿工打扮的道馆学徒拦住了他们，满脸歉意地解释道：“您是冠军小智先生吧！但是，非常抱歉。我们的馆主菊老大现在没空进行道馆战。”
“诶？为什么？”小智一脸不解。
“因为馆主现在正为了寻找复活草而四处奔波呢。”学徒无奈地摊了摊手，“听说在附近的米洛斯岛上，有关于复活草的线索。”
“米洛斯岛？复活草？”小智眼神一亮，“好！那我们就去米洛斯岛，把复活草找回来，这样就能和菊老大先生对战了！”
说干就干，三人立刻乘船，来到了传说中的米洛斯岛。
然而，眼前的景象却让他们大吃一惊。
本该是物产丰饶的岛屿，此刻却满目疮痍。
土地干裂，田地里的作物全都枯萎，甚至连附近的树木都像是被吸干了生命力一般，毫无生气。
空气中弥漫着一股不祥的死寂。
“这里……发生了什么？”艾莉丝看着这片毫无生机的土地，感觉有些难受。
就在这时，一个青年从岛屿深处的神社方向跑了过来，他看到小智一行人，焦急地问道：
“你们是来观光的吗？快离开这里！这里很危险……等等，您莫非是小智大人！”
“是的，其实我们是来寻找复活草的。”天桐礼貌地回答，“请问，你知道这里发生了什么吗？”
青年叹了口气，自我介绍名叫佑人，是这座岛上丰饶之社的守护者。
他解释道，这座岛屿之所以如此，是因为象征狂风的龙卷云和象征雷电的雷电云，不知为何突然降临此地并展开了激烈的战斗。
它们的争斗释放出巨大的能量，破坏了土地的生机。
“只有传说中的丰饶之神——土地云大人出现，才能平息它们的怒火。”佑人忧心忡忡地说道，“而复活草，也只有在土地云大人的力量下才能生长。我们必须在丰饶之社举行仪式，呼唤土地云大人降临！”
话音未落，天空突然暗了下来！
狂风呼啸，乌云汇聚，青色的、宛如恶神般的身影在云层中若隐若现，正是龙卷云！
它所到之处，卷起毁天灭地的龙卷风，将地面的一切都撕扯得粉碎！
“不好！龙卷云又来了！”佑人惊呼道。
“不能让它再破坏下去了！”小智眼神一凝，瞬间做出了决定。
“皮卡丘，准备战斗！”
“皮卡！”
但是一道奇怪的身影却快他们一步！
……
在小蓝和娜姿与科拿斗智斗勇的同时。
“真没想到，我们会在这种地方重逢。”希巴看着眼前的红帽少年，眼神中满是兴奋。
小赤的表情却很凝重，不远处的正辉大声提醒：“一定要小心，小赤！我的家就是被他那只该死的飞腿郎给一脚踹烂的！”
希巴闻言，却是一脸茫然：“嗯？我什么时候做过这种事？”
天幕的画面适时给出了注解：长期处于高强度战斗和被精神控制的状态，让希巴的记忆出现了混乱。他在失控状态下做的很多事，清醒后都不会记得。
【小茂：“原来如此，是某种程度的解离性失忆吗？看来四天王内部也并非铁板一块。”】
【渡：“希巴这家伙……还是这么沉迷于战斗。”】
虽然饱受记忆混乱的困扰，但此刻，期待已久的强敌就在眼前，希巴不想去想那些乱七八糟的。
他只想痛痛快快地打一场！
“来吧！小赤！让我看看你这两年，到底长进了多少！”
“快拳郎！火焰拳！”
希巴爆喝一声，快拳郎砂锅大的拳头燃起熊熊烈焰，朝着小赤的妙蛙花猛冲过来！
“又是这一招！”小赤眼神一凛。
当初在月见山，他就是因为轻视了对手，以为对方只会格斗系招式，结果快泳蛙被农夫三拳的混合攻击一招秒杀。
同样的错误，他绝不会犯第二次！
“妙蛙花，退后！”
小赤没有贸然选择属性克制的宝可梦迎击，他预判了对手的预判。
果然，就在快拳郎即将击中妙蛙花的瞬间，它燃烧的拳头上的火焰猛然熄灭，取而代之的是噼啪作响的金色电光！
雷光掌！
【小刚：“好快的切换！而且预判了小赤可能会换上水系宝可梦！”】
【阿桔：“哼，有点意思。这个希巴的战斗智商不低。”】
【希巴：“喂！什么意思，难道我的智商就低吗！你是想打架吗！”】
“哦呦？长能耐了啊，小子！”希巴见自己的佯攻被识破，非但不怒，反而更加兴奋，
“但是，我的快拳郎，能够同时使用火、电、冰三种属性的拳技！不管你换上什么宝可梦，我都有克制的办法！阁下，又将如何应对？！”
面对希巴的豪言，小赤只是微微一笑，露出了自信的表情。
“三种属性？巧了，我这里……也有一个这样的宝贝。”
他从腰间取出一颗精灵球，同时手中出现了三块闪耀着不同光芒的石头——火之石、水之石、雷之石！
“就让你见识一下！上吧，伊布！”
一只眼神灵动，但身上带着些许改造痕迹的伊布出现在场上。
【莉佳：“这……这不是之前被火箭队改造的那只伊布吗？”】
【正辉：“等等！那三块进化石……它们没有消失！他竟然能让伊布在三种形态之间自由切换？！”】
【希特隆：“这不科学！这完全违背了进化的规律！他是怎么做到的？！”】
天幕揭晓了答案：这正是在小赤在海底深处找到的，三块“不会消失的进化石”。
火箭队用残忍的生物实验赋予了伊布切换形态的能力，但伊布自己却无法控制，饱受折磨。
而这三块石头，则让伊布能够完美地掌控这一能力！
“这是……何等的外挂！”希巴看得目瞪口呆。