朱常洛大量的升赏和起复官员，自然是使得朝廷的官员振奋了一下，朱常洛展现出与朱翊钧完全不同的执政风格，大量起复官员，恢复朝廷的行政能力。
而在礼部的组织下，最重要的第三次劝进也正式开始了，中国自古以来就是三辞三让，而第三次劝进也是尤为重要的。
这次不仅仅是顺天府的官民人等，英国公张维贤领衔勋臣，首辅方从哲领衔文官等，集体叩阙上陈，向朱常洛呈递了劝进表章。
表章中说道：“天人协应，法舜、禹之代终；历数有归，昭启、诵之嗣服。故大德必得其位，惟至孝克缵厥猷。若逊让之未遑，将舆情其何惬？敢烦渎请，冀赐允俞。敬惟皇太子殿下，荷天眷命，席世累仁，圣学懋乎缉熙，睿质成于追琢。凤姿温润，蚤毓瑞于青宫；龙德正中，宜承庥于紫极。矧弥留之攸托，惟缵绪之是期。乃泰德初新，已见兆心之共戴；而谦光下济，犹然三让而不居。窃惟继志非圣人不能，即当宪天以出治；谅阴古帝王代有，贵在从礼而抑情，虽哀慕未适诸怀，而艰大必轸诸虑。是宜告之郊庙，光昭元子之成功；于以示诸华夷，丕着新君之一统。臣等用是瞻天恳请，局地恐惶，倘微忱之未通，将叩阍而不已。伏愿殿下慰群情而称明明后，思遗训而宅丕丕基，上贻文考以无忧，尽内外无不思服，远迈大禹之有子，凡血气莫不尊亲。臣等无任恳悃激切俟命之至。”
朱常洛于此祭告于大行皇帝梓宫之后，以令旨批答道：“皇考大行皇帝上宾，予哀痛悲号，五内摧裂。而文武群臣、军民耆老人等，以祖宗基业之重，皇考遗命之严，上笺劝进，至再至三，已悉忠恳。天位至尊，诚难久虚。况遗命在躬，不敢固避，勉从所请。”
同时给礼部下旨称：“皇考大行皇帝上宾，予哀痛悲号，五内摧裂。而军民耆老人等，以宗社基业之重，皇考遗命之严，上笺劝进，至再至三，义正辞恳，不得已，勉从所请。兹当祗告天地、宗庙社稷，即皇帝位，尔部择日具仪来闻。”
礼部立即与钦天监等衙门商量之后复奏：“臣等以大位不可久虚，万民不可无主，恭请于八月初一日即皇帝位，改明年为泰昌元年。”
朱常洛报可之后，礼部就开始拟定仪注，准备相关的各种仪式了，但是一件让朱常洛有些无奈的事情发生了，由于大明已经长期没有举行过朝会了，不管是内阁辅臣还是科道部院官员，对于大朝会的礼仪都是极为不熟悉的，而登基大典，又是断然不能够出现任何问题的。
所以礼部尚书孙如游奏请朱常洛：“登极大典，近因朝会久虚，礼部礼节未经闲习。拟文武百官青素服于文华殿演礼三日。”
朱常洛也予以同意了，在稳定了朝廷上的局面之后，朱常就开始处理宫内的事情了，虽然朱常洛已经将郑贵妃暂时软禁起来，隔绝她与外界的联系，但是郑贵妃的党羽众多，而且还有一个重要的问题，就是她毕竟是皇贵妃，即便朱常洛将朱翊钧的遗诏不加以执行，他仍然是现在宫内位份最高的妃嫔。
所以朱常洛必须剪除郑贵妃的羽翼，在万历四十八年七月二十八日，朱常洛要求工部勘察吉壤寿宫等事项，这点确实是非常之重要的，对于大行皇帝的寿宫，自然是不能轻忽的，朱常洛指令工部右侍郎王永光等人负责吉壤事务。
除了工部官员之外，内廷也在照例要派遣内侍前往督察工程的，这对于朱常洛来说就是一个非常难得的机会，朱常洛当即下旨：“升御马监掌印太监黄钧庭为司礼监秉笔、提督东厂办事官校卢受为司礼监秉笔，俱往巡视陵寝，督促工程。”
朱常洛给他们两人玩了一个明升暗降，名义上是将他们升为司礼监秉笔，但是将内廷之中极为重要的御马监和东厂的位置拿到手中，同时将他们两人打发去督促陵寝，免得他们和在宫内郑贵妃勾结起来，同时对于郑贵妃，现在朱常洛地位尚且没有完全稳固，对于郑贵妃还是要加以安抚。
朱常洛给兵部、礼部下达令旨称：“中军都督府左都督带俸王昇，至亲羽翼也，例当加恩，该部拟来详看。大行皇帝遗言皇贵妃郑氏勤劳，都指挥带俸郑养性，着加恩前军都督府都督佥事带俸，以全朕尽孝之意，大行皇帝酬勤之心也。”
朱常洛还派人向郑氏通报了此事，目的是很简单的，就是先稳住她，等到朱常洛坐稳了位置之后来处理此事。
而对于现在的大明来说，最重要的依旧是辽东事务，熊廷弼本来就是朱常洛力挺上位的，之前朱常洛也已经通过加官表明了自己的态度，但是由于辽东的重要性，朱常洛还单独给熊廷弼等人下达了一道令旨。
朱常洛在令旨中说道：“近因奴酋猖獗犯顺，陷我城堡，没我军民，特命经略熊廷弼运筹调度，亟图战守，拣选兵械，相机征剿，刻期剪灭。见今天气炎热，边方尤甚，暴露疆塲，劳苦忠勤，兹沛恩施，用彰抚慰。赐尔银一百两，纻丝四表里。益摅谋猷之忠，早奏荡平之绩。其在地方总兵等官，着该部开写来看。特谕。”
朱常洛的这份令旨一下达，朝廷上下都明白了朱常洛的意思，就是明白告诉朝廷上下，熊廷弼的地位不可动摇，之前两次升赏官员，都是成批升赏，而且熊廷弼也在其中获得了加官、赐服等赏赐，而朱常洛还专门下旨，慰劳熊廷弼，可见熊廷弼在朱常洛心中的地位。
除了这些之外，朝廷上下也在揣摩朱常洛的圣心，现在要是能够在朱常洛心中留下重要印象，对于自己的仕途是极为有利的，而此中高手就是礼部尚书孙如游。