除了募兵、练兵之外，还要保证士卒的军器甲胄和战马等装备才行，所以朱常洛命令毕懋康、徐光启、李之藻等人详细计算扩大遵化铁厂、长芦盐场、天津造船厂等官营工场所需要的资金，朱常洛调用内帑予以支给。
见朱常洛这么大手笔的支用内帑，李恩不得不劝谏道：“陛下，这些内帑都是先帝数十年的储积，一旦用尽，又从何而取？”
这点确实是现在最重要的问题，朱常洛即位不过半个月，内廷就已经花去了近三百万，主要都是军饷和犒赏银子，现在太仓已经是无银可发了，朝廷的财政困难恐怕一时半会是不会有所改变的，要是内帑用尽，朱常洛再拿什么去支应呢？
所以不仅仅要开内帑以解决朝廷现在的财政危机，更要开源才行，现在最可行的就是与倭国的贡市贸易了，每年可以为朝廷获取铜料四百万斤，还有数十万两的金银，但是现在最大的问题就是闽粤等地猖獗的走私使得朝廷的贡市贸易受到很大的影响。
所以必须要组建强大的水师，打击走私才行，制造船只需要大量的优良木料，而天津显然是不具备这个优势的，辽东有丰富的木料，但是缺乏人力，所以朱常洛命令加大向辽南移民的速度，除了屯垦之外，就是砍伐辽南、辽东的木料，然后经由水运抵达天津，用于制造船只。
而大明造船比较发达的地方还是在南方，除了朝廷所控制的清江船厂等官营船厂之外，闽粤等地有不少民间船厂，他们利用当地丰富的木料，制造船只，所以为了快速提升官军的运输能力，朱常洛命令闽粤等地督抚，在当地采办一些船只，主要是沙船、广船这种运输船只，补充天津海防水师。
而官军所用的战船，也要加紧制造，但是海舟这类战船体型较大，造价高昂。其四百料官船船长 9丈 4 尺，阔 1 丈 9 尺，而定海卫的五百料官船的船长更是达到了 12 丈 2尺 5 寸，阔也达到了3丈，据天津造船厂的奏报，五百料的福船，加上火炮等装备，总价达到了一千两之多。
而朝廷水师所需要的战船数量极为庞大，只能慢慢来，对于闽粤等地现在猖獗的走私行为，朱常洛虽然严令地方督抚打击，但是他自己也很清楚，这种诏书收效甚微。
现在朝廷要做的是加强海运和水师能力，先集中力量解决建州部的问题，才能够回头处理海上的事情。
所以朱常洛命令加大与倭国的贡市贸易，同时将所铸造的制钱运输到南方去，作为朝廷支给这些商人的费用，也借此机会推动朝廷制钱的流通。还要严令石昆玉、朱燮元等人保证漕粮和贡市物资的征收解运。
而在朱常洛即位并且批答奏疏之后，大明官员上疏的热情空前高涨，通政司每天都在加班加点的整理这些奏疏，不仅仅朱常洛疲于应付，首辅方从哲也感到实在是难以支应。
他本来就是单核内阁，之前熬老头已经熬的他有些吃不消了，现在骤然又是这么多的章奏，即便朱常洛也会留中一部分，但是这些章奏的数量还是极为庞大的，所以方从哲赶紧给朱常洛上疏，要求催促已经起复的两位阁臣叶向高、吴道南立即入阁办事，不准迟误，同时再点用阁臣两三员，以分理政务。
方从哲的奏疏一上来，又是一帮官员纷纷上疏，要求朱常洛下旨廷推阁臣，朱常洛当然知道他们的意思，现在内阁只有三人，方从哲、叶向高、吴道南，两个还没到任，方从哲又早有去意，是干不了多久的，而朱常洛所信重的讲官们，刚刚提拔过了，资历还尚浅，如果廷推阁臣的话，就是各派政治力量的大乱斗了。
朱常洛从奏疏之中也看的出来，比如李三才、邹元标等人都再度成为热门人选，对于这事，朱常洛没有立即回复，准备先发酵一下，他命令文书房将这些举荐阁臣的奏疏加以统计，看看是哪些人受到朝臣的举荐。
而李恩也向朱常洛单独呈递了一份奏疏，是科道的，朱常洛看过之后不得不佩服大明官员搞政治投机或者说是搞斗争的能力。
皇城巡视兵科给事中魏应嘉等言：“禁门严肃，乃出入猥杂，不异通衢，非宸居之体。即内市一节，前此诸臣抗章请革，竟付空言。礼仪房长随董国用，辄将宫内不堪女子赵永禄女等八口领出北安门，着伊亲领去。若未明旨，辄尔私发私领，守卫不敢拦阻，万一奸伪滋生，何以肃清辇下？且先年梃击之案，皇上岂不念之乎？乞皇上涣发德音，明白谕戒。然臣更有请者，怨女出宫，古今盛德之事。自穆庙至先帝两朝，迄今凡五十余年矣。其间侍从宫人，空闲无职，何啻以千百数。夫人垂老倍思其乡，未衰尽堪生聚。皇上举事发，俱合大经大典。即此一事，不必问无例有例，慨然拣选，独断施行，令此老惫及无职者各依其亲，则海宇欢呼，仁慈无极。臣事效忠，伏恳圣明省览。”
魏应嘉的意思是要严肃宫禁，同时将宫内的这个年纪大的宫女等清理出来，当然在这个关口，实际上就是将郑贵妃的势力借由此事扫地出门了。
朱常洛看了之后对李恩说道：“宫闱宿卫，事体犹重，不可轻忽，此事李公公要拿出一个章程来。”
李恩问道：“那魏应嘉如何处置？”
朱常洛想了一下说道：“魏应嘉妄言宫内之事，本当严惩，姑念一片愚忠，调太仆少卿。”
现在朱常洛刚刚缓和了和郑贵妃的关系，这个时候要以稳为主，徐徐图之，不能逼得有些人狗急跳墙了，所以明面上朱常洛不能肯定魏应嘉的话，所以予以申斥，但是实际上，朱常洛将魏应嘉从兵科给事中调太仆少卿，已经是升迁了，就是他魏应嘉九年科道考满，也未必有太仆少卿这样的好位置给他，这一把算是投机成功，偷着乐去吧。