朱常洛自然是很清楚，建州不可速灭，辽东不可速进的，一定要持重用兵，不能浪战，官军现在刚刚建立起来对于建州部的优势，这个时候就更加要稳住才行。
对于新收复的萨尔浒城以及新建的两座边堡，朱常洛将其命名为安虏、靖虏、平虏，以表达朱常洛对于安定辽东的希望。
不过现在朝廷上下关注的还是被抓获的这些东林党人的情况，钱一本等人已经被逮入北镇抚司有一段时间了，但是朱常洛并未就此事做出回应，这是一个极为要命的事情，此事一直悬而未决，对于朝廷来说也不是什么好事。
朱常洛对于东林一向观感不好，这在大明朝廷已经不是什么秘闻的，但是这次对于这些人，朱常洛采取了关而不审的态度，也是非常之奇怪的，而朝廷各派政治势力也在就此事展开行动。
东林党人自然是要想办法营救钱一本等人，但是对于东南士绅们来说，事情就比较复杂了，一方面东南士绅们和东林党人之间还是很很亲密的关系，如孙慎行等人还是希望事情不要搞得这么难看，申用懋对于此事也比较头疼。
但是如王时敏等人就坚决要求借此机会严惩李三才，对于王家来说，李三才确实是绝对不能容忍的人，王锡爵对于李三才加意提拔保护，但是李三才最后却出卖了王锡爵，当年李三才给朱翊钧的密疏，为了防止泄露，王锡爵专门让王时敏代笔，原因很简单，就是因为王时敏是当世书法大家。
李三才得知书信内容之后，毫不犹豫的将王锡爵给卖了，彻底断绝了王锡爵复出的道路，所以王时敏向朱常洛上疏，陈述李三才当年构陷重臣，请求严惩。
朱常洛对于东林搞得这些小动作也是极为厌恶的，所以命令厂卫严审李三才，同时查抄其家产，李三才当了多年的总督漕运，家资不菲，这些钱财，可不是靠俸禄得的，这点朱常洛是很清楚的，用这招也可以沉重的打击东林党人的气焰。
而方从哲等辅臣也向朱常洛上疏，希望尽快了结此事，免得朝廷因为此事而动荡，朱常洛没有批复阁臣们的奏疏，只要求他们先对现在朝廷上对于辽东的议论按下去再说。
很快户部和兵部就上疏，陈述现在朝廷的实际情况，主要就是钱粮的问题，今年山东大旱，陕西、河南也接连遭灾，户部为了救灾都已经花费了不少，太仓已经没有足够的钱粮在支应辽东的战事的，而兵部也上疏指出大军连续作战已经数月，同时临近严冬，不利作战，应该暂时停止战事，等待天气转暖再做计较。
朱常洛给辽东经略熊廷弼下旨，要求他相机区处，妥为奏闻。
得到朱常洛的上谕之后，熊廷弼首先就是将开原边外的官军骑兵撤回，现在建州部已经撤走了，科尔沁部是没有的胆子乱来的，所以官军也将骑兵调回，勇士营和其他援辽之兵回归驻地，而辽东镇骑兵赶赴抚顺等地，加强对于建州部的压力。
贺世贤、邹储贤率领辽东精骑赶赴抚顺，但是熊廷弼没有将他们全部投入抚顺这边，只是将部分骑兵投入抚顺战场，熊廷弼命令邹储贤率领辽东骑兵主力，出鸦鹘关袭扰建州部，以为疑兵，同时和出清河的刘綎部互相呼应，营造出官军从东西两个方向夹击赫图阿拉的态势。
而努尔哈赤也在仔细的查看战场形势，官军仅用了两天就攻陷萨尔浒城这是努尔哈赤所没有想到的，扬古利毕竟也算是建州部的骁将了，费英东之前请求趁官军立足未稳，发动反击，重新夺回萨尔浒，但是被努尔哈赤所否决了。
努尔哈赤的考量是官军守城能力本来就很强，而且萨尔浒易守难攻，建州部去进攻的话，未必讨得到什么好处，而且这也有可能是官军的圈套，利用萨尔浒城将建州部主力吸引出赫图阿拉，好为官军夺取赫图阿拉做准备，尤其是在官军骑兵在鸦鹘关出现之后，努尔哈赤更加坚信自己的判断。
准备以主力据守赫图阿拉，通过这种方式应对官军的进犯，而熊廷弼则是传令各部官军加紧修筑边堡，囤积各种作战物资，以准备防备建州部的反扑。
尤其是萨尔浒城，也就是现在靖虏堡，是抵御建州部的前哨，官军除了修复之前建州部所建筑的城池之外，也进行了大规模的改造和扩建，加强靖虏堡的防御能力，同时在靖虏堡内囤积了大量的粮秣、守城器械等物资，防止建州部进行长期的围攻。
皇太极和代善率兵赶回来之后，了解到了现在的情况之后，皇太极当即求见努尔哈赤，面陈自己的想法，皇太极说道：“父汗，明狗所谓诸路大军，都只不过是疑兵罢了，其主力只在抚顺一路。”
努尔哈赤说道：“这下我都知道了，关键是眼下应该如何对付的问题。”
皇太极当即说道：“父汗，萨尔浒乃咽喉要道，现为明狗所占，此断不能容忍之事，儿臣请命，领兵夺回萨尔浒城。”
努尔哈赤没有说话，皇太极陈述了自己的看法，他认为官军不管是开原、辽南、鸦鹘关之兵都是疑兵，主要打痛其中一路，必然就能够击退官军，然后建州部再集中兵力对付抚顺方向的官军。
这点也得到了努尔哈赤的支持，他将驻守赫图阿拉的巴牙喇兵交给皇太极指挥，其余巴牙喇兵暂时休整，皇太极首先率兵打击的就是从鸦鹘关出击的辽东骑兵。
本来熊廷弼估计皇太极回援之后，就已经传令各路官军小心谨慎，将部队尽可能的收拢，官军现在已经算是完成了大部分任务，没有必要在这个时候和建州部打一场无谓之战。
但是熊廷弼还是低估了皇太极的行动能力，皇太极回到赫图阿拉当天面见完努尔哈赤之后，就率兵出发，代善则整顿城内兵马。