除了这件事情之外，铨选和邪教问题也是朱常洛所关心的问题，孙如游也都给出了相应的解决方案，朱常洛还是比较满意的，但是现在朱常洛不能骤然提拔孙如游，从礼部左侍郎署部事升礼部尚书，已经是提拔了，要是立马让他入阁，那朝野哗然，不管是对于朱常洛还是孙如游都没有任何好处。
所以朱常洛将孙如游的奏疏下内阁命部院商议，采其可行者行之，同时赐孙如游斗牛服一件，御膳一桌，犀角带一条，朱常洛的意思是很明显的，就是奏疏我已经看到了，很满意，但是之前也已经提拔了你，先赏赐一些物质上的东西，只要有机会就会考虑你老孙的。
而孙如游也很懂事，目的既然已经达到了，就不要再上疏了，这就是孙如游这些老油条最大的好处，他们懂得分寸，既然朱常洛已经做出了回应，那就算是达到目的了，不要再去连篇累牍的上疏渎扰了。
而吏部也向朱常洛上陈了审核之后要起复的名单，一共起复官员六十余名，加上之前翰林院散官授职和考选行取御史五十五员，朱常洛管事不到十天，就已经补缺一百二十员了，不过这些官员仅仅将朝廷各部院以及六科的空缺堪堪补上了，地方还有大量的亲民官空虚没有补上，朱常洛命令作速补给。
同时就八月初一日的即位大典了，礼部已经拟定了详细的仪注，朱常洛只需要参照执行就行了，首先朱常洛先遣官于八月初一日早祗告天地、宗庙、社稷。
初一日早，朱常洛具孝服，亲诣大行皇帝几筵祗告。受命毕，乃具衮冕服，行告天地礼，随赴奉先殿谒告祖宗毕，仍具衮冕服，诣大行皇帝几筵前，孝懿皇后几筵，各行五拜三叩头礼，诣温肃端静纯懿皇贵妃神主前行四拜礼毕，诣文华殿即位。
随后，教坊司、钟鼓司鸣钟鼓，锦衣卫设卤簿大驾，朱常洛服衮冕，御文华后殿。文武官员各具朝服，入丹墀内伺候。鸿胪寺引执事官进至文华后殿。
将行礼之时，照旧制传旨：百官免宣表，免贺，只行五拜三叩头礼。传毕，方引执事官就次行礼。赞各供事，奏请升殿。
朱常洛由中门出，升宝座。锦衣卫鸣鞭，鸿胪寺赞五拜三叩头礼讫，百官出，至承天门外俟。翰林院官捧诏授礼部官，置诏于案上云盘内，从殿左门出，至午门外，礼部官捧诏置云舆内，迎至承天门上，开读行礼如常仪。
即位诏书是方从哲于翰林院所拟定，经过朱常洛审定之后确定，基本和之前的即位诏书大同小异，而在即位大典之后，就是宫殿的搬迁了，朱常洛之前是太子，自然居住在慈庆宫，但是现在即位之后，朱常洛和后妃等也要搬到乾清宫以及相应的宫殿内去。
同时大行皇帝的妃嫔则是要迁居慈宁宫去，其中最重要的自然是郑贵妃了，之前朱常洛就已经派李恩去知会郑贵妃，让他收拾东西，准备从翊坤宫迁居慈宁宫，这里是太后、太妃等前朝后妃的奉养之所。除了作为太后、太妃的寝宫，慈宁宫也是举行给皇太后上徽号、册立后妃以及元旦、冬至、万寿节等皇家庆典和宴会的重要场所。
但是郑贵妃不愿迁出，因为她手中有诏书，她要朱常洛履行朱翊钧的遗诏，晋封皇后，朱常洛不由得冷笑一声，将孙如游的奏疏给李恩，叫他给郑贵妃看，朱常洛的意思自然是很明确的，不是朕不办，礼部不同意此事，朕也没有办法。
郑贵妃认为自己就赖在翊坤宫，就能够把朱常洛给拿捏住了，朱常洛对于此事也早有预料，毕竟晋封皇后是郑贵妃想了一辈子的事情，现在好不容易有了朱翊钧的遗诏在手，他自然是要逼迫朱常洛达成自己毕生的心愿，成为皇太后。
李恩回来之后问道：“陛下，不若老奴带一些内侍去帮娘娘搬家。”
李恩的意思也是很明确的，既然郑贵妃不想搬家，那李恩就去帮帮他，软的不行，那就来硬的，但是朱常洛制止了李恩的这个想法。
他对李恩说道：“皇考梓宫尚在，朕若如此，非人子尽孝之道也。”
这点确实是很重要的事情，毕竟现在朱翊钧刚刚去世，而且确实是有遗诏册立郑贵妃为皇后的，不管这个要求是否合理，诏书是存在的，朱常洛作为人子，不能在明面上直接反对自己老爹，而且郑氏毕竟是宠妃，现在就对他动手，打的是朱常洛这个新君的脸。
但是郑贵妃所要求的履行朱翊钧的遗诏，这也是万万不可能的，朱常洛是要追册皇后，但是那也只能是自己的生母，不可能是追尊郑贵妃为皇太后的。
朱常洛思虑了一下之后，对李恩说道：“如此，那朕就不搬了，慈庆宫毕竟熟悉，也不急于一时嘛。”
李恩当即明白了朱常洛的意思，朱常洛是不会亲自动手来对付郑贵妃的，毕竟这于礼不合，但是大明这么多的官员们，他们怎么可能坐视此事？皇帝即位之后仍然居于慈庆宫，这是亘古未有的事情，郑贵妃作为先帝妃嫔，还不搬出去，这是何道理？
所以朱常洛照旧居住在慈庆宫，同时在文华殿办公，处理政务，因为这里离内阁所在的文渊阁很近，方便朱常洛随时召见大臣。
而对于宫内的事情，朱常洛也命令不得传出来，让官员们自己去发现此事，等到八月初三日，一些官员终于发现情形不对了，朱常洛即位已经三天了，怎么还居住在慈庆宫，而且朝会也没有正常召开，虽然朱常洛召见大臣很频繁，但是朝会制度却没有恢复，不少官员感到很诧异。
所以科道、九卿等重臣纷纷奏请朱常洛重开朝会，与大小臣工见面，首辅方从哲也请求朱常洛勤御朝讲，与官员们多接触。